医疗卫生部是组委会负责亚运会医疗卫生服务保障的部门。其主要职责为:
(1)负责组织、协调亚运会医疗服务工作;
(2)负责与亚奥理事会医学委员会、各国家(地区)奥委会医务官员的联络、协调工作;
(3)负责亚运会公共卫生安全保障、医疗急救、出入境卫生检疫的协调工作;
(4)协助亚奥理事会医学委员会开展兴奋剂检测、性别鉴定等工作。
组委会各工作部门根据筹备工作进展需要分期分批成立。组委会的工作部门设置及职能根据筹备工作的需要调整和变更。